セッションは自動的に管理することが可能です。自動管理時はCGIKit側でセッションの読み込みと保存が行われます。自動管理を設定すると、CGIKitアプリケーションにアクセスしたときに必ずセッションが生成されます。
自動管理を有効にするには、CKApplication#manage_session属性をtrueに設定にしてください（デフォルトはfalseです）。